Plateforme en Biologie Moléculaire et Bio-informatique

  • Expertise dans l’extraction des acides nucléiques issues de matrices complexes et le séquençage du gène 16S.
  • Analyse experte en bio-informatique de la diversité procaryote via du séquençage haut débit.
  • Formation

la plateforme en bref

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Biodiversité procaryotique des écosystèmes

OMICS met son expertise en biologie moléculaire et bio-informatique au service des instituts de recherche publics ou privés, pour explorer la diversité microbienne des écosystèmes marins, par séquençage haut débit ou métabolomique (métabolites carbonés, soufrés et gazeux).

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Une plateforme sous les tutelles de :

AMU
CNRS
IRD
Université de Toulon

Nos Domaines d'expertise

FORMATION

BIOLOGIE MOLÉCULAIRE

BIO-INFORMATIQUE

ÉCOLOGIE MICROBIENNE

Notre offre de prestations

Prestations

  • Caractérisation taxonomique des procaryotes dans les écosystèmes
  • Extraction-Contrôle Qualité Séquençage ADN/ARN
  • Analyse bio-informatique biodiversité

Formation

  • Formation à l’analyse de données de metabarcoding
  • Formations Extraction ARN, d’ADN et qPCR.

Mise à disposition

  • D’appareils destinés à l’extraction, l’amplification, et le contrôle qualité des acides nucléiques (ADN et/ou ARN) et le séquençage long reads pour le séquençage des communautés procaryotes basé sur le gène de l’ADN ribosomal 16S.

Nos autres labels, certifications & réseaux

ISO 9001 :2015

Nos équipements

Système de PCR digitale Qiagen, par nanoplaques, intégrant le partionnement, le thermocyclage et l’imagerie en un seul instrument. Capacité de multiplexage : 12.

QIAcuity One(dPCR)

Séquenceur Oxford Nanopore de troisième génération, fournissant des lectures longues d’ADN et d’ARN en temps réel, adaptées aux études génomiques, métagénomiques…

GridIon

Thermocycleur Bio‑Rad réalisant des PCR quantitatives en temps réel avec détection fluorescente, adapté à une large gamme d’applications moléculaires.

OPUS (qPCR)

PCR

La TapeStation et le Bioanalyzer d’Agilent assurent l’analyse automatisée et précise de la qualité et de la quantité d’ADN et d’ARN.

TAPE STATION BIOANALYZER

QIAcube (Qiagen) : extraction automatisée et reproductible d’ADN et d’ARN à partir de différents types d’échantillons, jusqu’à 12 échantillons par run.

QIACUBE

Extraction automatisée d’ADN et d’ARN à l’aide de billes magnétiques, jusqu’à 32 échantillons par run.

MAGNETAPURE32

FAST PREP

GC-MS

IONIQUE

GC

FID

Nos domaines d'application

INDUSTRIE PHARMACEUTIQUE, AGROALIMENTAIRE, ENVIRONNEMENT, MÉDICAL

  • Analyse et suivi de la biodiversité
  • Identification de marqueurs taxonomiques
  • Quantification des populations
  • Identification et suivi de pathogènes

FORMATION

  • Formation avancée en analyse de données de metabarcoding
  • Formation aux techniques de biologie moléculaire

Collaborons ensemble

N'hésitez pas à nous contacter pour toute question ou renseignement via ce formulaire de contact.

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Sonia Bouchard

Responsable de la plateforme

Institut Méditerranéen d’Océanologie - MIO
Campus Technologique et Scientifique Luminy
163 avenue de Luminy, Bat Oceanomed
13288 MARSEILLE cedex 09